清洁牙齿是保护牙周健康的主要方法，龈上洁治和龈下刮治是需要医生来完成的，但是，要想很好的控制菌斑，还需要患者的日常维护。常用的方法有以下几种：

(1)刷牙：刷牙是自我清除牙面菌斑的主要手段，设计合理的牙刷和正确的刷牙方法能有效地清除牙菌斑。一般主张每天早、晚各刷1次，也可午饭后增加1次，每次刷牙不少于3分钟。 

(2)牙线：牙齿的邻面和牙间隙容易堆积菌斑，是牙周疾病好发的部位，单靠刷牙难以消除该处的菌斑，牙线是最有效的工具，尤其是对于有牙间乳头充满的牙间隙更为适用。使用时取一段长约20厘米的牙线，两端打结形成一个线圈。用双手的拇指或食指将线圈绷紧，两指间相距约1厘米～1.5厘米，将此段牙线轻轻从咬合面通过两牙之间的接触点。如接触点较紧不易通过时，可作颊、舌向拉锯动作，即可通过。将牙线紧贴牙颈部，然后在邻面作上、下移动，每一个牙齿要上、下刮4～6次，直到将菌斑刮净。然后将牙线反绕到相邻牙的邻面颈部重复以上动作。如此逐个将全口牙齿邻面清洁干净。每清除完一个区域的菌斑后，以清水漱口，并用流水清洗牙线上的菌斑。

(3)牙签：在牙周治疗后牙间乳头退缩或牙间隙增大的情况下，可用牙签来清洁邻面菌斑和根分叉区。应选用硬质木制或塑料制的、光滑无毛刺的牙签，将邻面上的菌斑刮净。

(4)其他工具：如牙间隙刷、锥形橡皮尖及牙线夹等，均为清洁邻面和按摩牙间乳头的良好的工具。